在阿斯塔特的協助之下，尚塔夫領主成功逃離王宮，並且去尋找沒有被感染的軍隊，在經過一天的時間，約八成的星球駐軍重新對尚塔夫領主宣誓效忠，但仍有兩成的星球駐軍基因竊取者的控制之下；為了要戰勝這些狡詐的基因竊取者，阿斯塔特與星球駐軍組成臨時性的聯軍，在與基因竊取者經過了兩個星期的交火，聯軍在戰團長弗朗茨.阿托瑞斯的領導下，殲滅約七千名的叛軍及兩千名的基因竊取者，但並不為戰事帶來任何的優勢，因為被感染的叛軍只占基因竊取者的一部分；基因竊取者還包含有陰險又狡猾的純血，身體部分變異可以使用人類武器的混血，以及身體異常強壯的畸變體，且都藏身在礦坑之中；聯軍常被從礦坑中竄出的敵軍，影響了進攻的節奏，甚至是遭受嚴重打擊。
在戰事持續三周之後，從不動山巔母星的補給艦送來了能扭轉戰局的武器，除了有戰團裡所有的八台的無畏機甲，還有由技術軍士萊索爾.卡爾斯內奇所研發的特製燃燒彈，這是一種以周邊氧氣為媒介，將一切都燃燒殆盡的炸彈，除了要面對熊熊的烈火之外，在燃燒過外的無氧狀態，才是最致命的武器，是專門設計用來對付坑道內的敵人。在使用特製燃燒彈之後，阿斯塔特一度取得戰略上的優勢，迫使基因竊取者們必須要離開礦坑之中，但基因竊取者的數量遠超逾阿斯塔特的預期，超過六千名的基因竊取者從礦坑中竄出，但星球上的聯軍只剩下約八千多名駐軍及四百名阿斯塔特。
聯軍則是嘗試著在基因竊取者剛從坑道竄出，還沒有完整陣型的時候，盡量的消滅基因竊取者的數量，此計畫在一開始是成功的，那些抱頭鼠竄的基因竊取者剛跑出坑道時，就被等待在坑道外的部隊消滅；但這一情況也並沒有維持太久，基因竊取者貌似接收到蟲巢領導者的召喚，開始集中到兩處地點集合，形成兩股龐大的勢力。
在基因竊取者那邊主要有兩個領導者，其一是蟲巢族長，他是一個身型巨碩大的純血種，擁有著兩對巨大的撕裂爪，且具有靈能能力，可以使用類似心電感應的能力，來指揮周遭的基因竊取者；另一個是古德曼，他是一個帶四代的混血種，同樣身為靈能者，除了心電感應的能力，還能對敵方進行心靈控制，迫使他們做出違背意願之事；基因竊取者在蟲巢族長和古德曼的分頭帶領之下，蟲巢族長攻向戰團長弗朗茨.阿托瑞斯所在的前線基地；主教古德曼則是往王宮的方向進攻，這場基因竊取者與帝國方將迎來最後的決戰。
蟲巢族長帶領著多過於聯軍五倍人數的基因竊取者包圍著戰團長弗朗茨.阿托瑞斯所在的前線基地，前線基地中，除了戰團長，還有由榮譽衛隊隊長托雷烏斯.洛丹所帶領的榮譽衛隊，以及七百多名的駐軍；就在基因竊取者正要發起總攻擊時，從貿易港的上空突然降下數百個噴射背包的身影，身穿灰綠色動力甲的先驅者及先鋒老兵，對包圍貿易港的基因竊取者進行攻擊；原來是剛好在附近的三爪鴉戰團，接收到了求援的信息而趕來援助。
另一方面，古德曼帶領著基因竊取者來到了王宮的前方，然而在王宮前方有著八個巨大身形，八台無畏機甲一字排開，宛如是王宮的城牆般聳立於此；在戰鬥的一開始，古德曼還想依靠著人數來來戰術上的優勢，但古德曼小看這些無畏機甲的火力，無論是混血的人海攻勢，還是奇美拉裝甲車的正面攻擊，都在風暴爆彈槍及多管熱熔槍的槍口下被無情粉碎；在發動兩、三波的進攻未果時，古德曼改變策略，想藉由引誘無畏機甲到市區中，藉此分散無畏機甲的戰力，再一一擊破；但令古德曼所意想不到的是，在他進攻王宮的這段時間，另一邊的基因竊取者已被趕來支援的太空鯊魚戰團殲滅，星球上其餘不動山巔的阿斯塔特們正趕往王宮的方向。
