很久很久以前，在世界还未形成之时，有一条拥有强大力量的龙，它因为过于寂寞决定创造世界，但是创造世界需要的力量过于庞大，导致龙耗尽力量死去，死前它最后的创世之力化为源数代码，眼泪化为月球，本体成为了开启创世之力的钥匙-No.100 源数龙。
时间过去了很久，世界逐渐分为两个次元-人类世界和星光体世界，星光体世界相对于人类世界来说是高阶的世界，由能量构成，只有被选中的灵魂才能进入星光界，类似于天堂。之后，星光体世界为了追求更加高阶的境界，抛弃了混沌(chaos)的存在，追求不断升阶，被抛弃的混沌组成了巴利安世界。随着星光界不断的升阶，巴利安世界愈发强大，星光界却由于混沌的缺失不断衰弱。终于，星光界与巴利安世界的战斗开始了，巴利安世界的首领-上千主上，与星光界的使者-Astral展开了战斗，最后Astral取得了胜利，将上千主上成功封印，并将上千主上的力量分成七份，用七张No.卡镇压。但是Astral在这场战斗中也损失惨重，自己的一部分被轰开进入了人类世界，而上千主上的一部分(混沌)进入了Astral的体内。
上千主上并不甘心就这样被封印，他想方设法想要脱出禁锢。经过了很长时间，封印松动，他很小一部分力量泄露了出来，化作人形，开始在人类世界活动。此时，作为封印的七张No.卡随着时间流逝辗转到了七位不同人类的手中，并因为他们的灵魂本质而呈现不同的样子(印卡)。上千主上通过直接或者间接的影响，使这七位拥有高贵灵魂的人类堕入黑暗，成为了巴利安七皇，继续对抗星光界，并等待着自己复活的时机。巴利安七皇可以说是继承了上千主上的力量，拥有着超百No.101~107作为王牌，还有升阶魔法巴利安之力，实力十分强大。但是，在经过了那场远古大战之后，巴利安世界与星光界无法直接互相干涉，这也就意味着巴利安界与星光界的较量只能通过人类世界间接进行。此时人类世界对异世界的研究也有了进展，菲卡博士、拜隆博士、冒险家九十九一马组成队伍探索异世界，菲卡博士却在异次元之门反水，将拜隆和一马献祭，打开了异次元之门与巴利安交流，并获得了巴利安的力量给了阳斗，让阳斗续命并攻击星光界，还组成了银河眼卡组给快斗使用。被献祭的拜隆和一马则分别进入了巴利安界与星光界。
虽然说巴利安界对星光界的战争一致对外，但是内部其实还是有着不和谐。七皇中的贝库塔和纳修，关系就一直不好。两人的前世就有非常深的过节，成为七皇后依然互相不对付。贝库塔生性狡诈，用计绑架梅拉古，让纳修和梅拉古一同死亡。幸好纳修前世的海神保存了两人的灵魂，让二人投身进人类世界，进入了发生车祸刚刚死亡的神代两兄妹体内，作为人类继续活着。
再来说说Astral分裂出的残魂吧。这魂魄被投入了人类世界，经过了很长时间，成为了人类，投胎到了九十九一家，成为了九十九游马(主角)。一马一开始并不知道他们儿子的身份，直到一次极地探险，一马不慎坠崖，却意外进入了星光界，遇见了Astral，并看见了那场远古大战，知道了事情的来龙去脉，也知道了自己儿子是Astral的分身，并得到了皇之键。之后一马生还，并全身心投入到对异次元世界以及与其相关的遗迹的探索中，直到被菲卡献祭。
此时，星光界一直被来自人类世界的菲卡博士攻击。为了消灭巴利安世界，星光界作下决断——派遣Astral前往人类世界，寻找源数代码，消灭巴利安世界。但是，九十九一马修改了Astral进入人类世界的参数，以皇之键为坐标，让Astral与游马相撞，使Astral的力量与记忆分成No.卡四处飞散。
就这样，zexal的故事，开始了。
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原作者：惠爺的三圍之力)
