冷兵器類
弓與弩:在槍砲等熱兵器問世前,弓箭一直在戰場跟日常生活中為人類忠心耿耿的服務著;而在槍砲誕生早期,水手們在海上戰鬥時仍是使用弓箭,因為當時的火藥非常容易受潮,而且開槍時的火花很有可能引燃船帆,最重要的是弓箭的成本遠比火槍低廉;順帶一提,儘管在遊戲裡不曾出現,不過當時仍有不少海軍士兵會使用弓箭。
刀劍:刀劍類兵器是世界上所有武器中,為人類服役最為久遠的兵器,在今天這個槍砲滿天飛,弓箭與槍矛都淡出歷史舞台的時代,刀劍仍是許多國家軍隊的標準配備。而在那個時代裡,刀劍除了武器外,也是種身分地位的象徵;那些(黑)長直且做工精細的刺劍是地位較高的人才有資格使用的,一般的海盜們用的還是以劈砍為主的彎刀、刀刃寬的短劍和匕首,不過也不是沒有例外,法蘭西斯.德雷克船長佩帶的就是長直細劍(玩家可在特典—獻祭之島中找到);話又說回來,這類刀劍對海盜來說可遠比那些細劍要來得好用多了,你既不用擔心戳了人之後拔不出來,也不用會什麼繁瑣的西洋劍術,而且在非戰鬥時還能用來切肉或水果。
長柄武器:在海盜的黃金年代裡,戟和長矛等長柄兵器的地位已經被刺刀所取代,唯一還被水手們使用著的,就只剩下斧頭了。3英呎長的斧頭雖然比刀劍來的笨重(當然,印地安人用的戰斧又是另一回事了),但是會用到它的地方卻比刀劍多太多了;落海時可以用來爬上船(如果你手上正好有一把的話),當敵人用鉤繩時可以用來斷開鎖鏈,敵人死守船艙時可以用來破門,修船時還能當槌子用;印地安戰斧耍的好的話,還能讓你在星爺的電影裡尬一腳,如果他還想再拍斧頭幫的話(笑)。
熱兵器類
火槍:對海盜們來說,火槍並不是首選武器,因為火藥在海上很容易受潮,這讓火槍變得很靠不住,而且在生死懸於一線的戰場上也不會有多餘的時間去重新填裝子彈,再加上5英呎長的火槍也不適合甲板上的白刃戰,海盜們通常只有在打獵或上岸搶劫時才會用到它;儘管在海盜的黃金年代裡,火槍的發展已經有了相當的水準,隨著火藥跟擊發裝置的改良,火槍的性能跟穩定度都有所成長,但是這些優點都比不上只能裝一發的要命缺陷。
手槍:跟火槍不同,手槍是海盜們最愛用的兵器。因為它的體積小,一個人可以在身上帶個好幾把—就像遊戲裡的黑鬍子與肯威那樣;配戴多把手槍不只在戰鬥時威力驚人,還能在火藥受潮有替代品可用,就算真的有人倒霉到每把槍都受潮,握住槍身後用槍柄給對手的腦袋狠狠來一發也很有效果。此外,在戰鬥結束後,第一個登上敵船的海盜有權利第一個挑選戰利品,通常這種情況下那位海盜都會選擇手槍。
其他:除了上述的武器之外,海盜們也會使用手榴彈,不過更多情況下他們用的還是製作容易又低成本的汽油彈(當然,那個時代用的還不是汽油);除此之外,一種名為臭罐的煙霧彈也很受歡迎,簡單說來就是將硫磺或什麼的,反正就是薩奇一天到晚要他手下聞的,那些一被點燃就會產生難聞煙霧的鬼東西裝在罐子裡,使用時只要在罐子上放個點燃後往對手的船上扔過去就大功告成了。