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突變的擴散機率

光山アキラやま | 2012-02-26 16:09:02 | 巴幣 0 | 人氣 381

轉自西米露

Whytockia (sasakii)  

中性突變的對偶基因,要在族群內擴張開到整個族群都是 (也就是fixation)的機率是
1/2N    (N = (有效)族群量)
                                                                                
而有利突變的對偶基因則是
2s (s=選汰係數,即有利突變的適應值減掉野生型突變的適應值)
                                                                                
                                                                                
要計算中性片段的取代率 (K)
K = 2N * u * 1/2N  (u = 突變率)
                                                                                
解釋:2N 這邊談的是二倍體生物
如果該二倍體生物的族群量為N,每個個體有2套染色體
故總套數為2 * N
然後總套數乘上突變率,也就是平均突變的總量,故為2Nu
但這些突變產生之後
也可能因為漂變 (drift)喪失
依據前人估計中性突變能逃過漂變魔掌而不被踢除掉的機率為1/2N
將突變總量乘上固定機率 即得 K = u  (基因的取代率 = 突變率)

                                                                
而有利的片段取代率呢
                                                                                
以上者來看
即為 K = 2N * u * 2s = 4Nus
                                                                                
                                                                                
記一下在這裡
也讓對分子演化及族群遺傳有興趣的人來討論
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positive selection不是萬能
愈算下去,愈覺得如此

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